Это отражено в официальном учете?
Нет, не будет. Если будете аргументировать питанием, то обязаны были делать соответствующие вычеты из зарплаты персонала.
А какой тогда в них смысл?
Вы излагаете все вполне внятно. Можете смело идти к управляющему/учредителю и заявлять, что бухгалтерия ничего не понимает в ведении товароучета в общепите. Это они в данном случае дилетанты. Частое явление, увы. Только обычно не так все запущено. Требуйте сторонний аудит бухгалтерии. Скорее всего, учет у них полностью засран.
Двойной учет ведется?