Поставить можно в срок до 31/12/16.
Но вроде бы как нельзя продать то, что не поставлено на учет (есть подозрение что за 4-ый квартал и по продажам отчитываться придется).

Вот тут http://egais.ru/news/view?id=1478 говорится:
"С целью исполнения указанной обязанности, Служба напоминает, что остатки продукции в системе ЕГАИС должны быть приведены в соответствие с фактическими в срок до 01.01.2017."