Далее, отпишу свое мнение по поводу "неприятностей".
П.1 в последних версиях идет в сад, т.к. можно назначить категорию сразу на группу.
П.2 аналогично.
П.3 - советую выгружать расходные накладные. Да, акты реализации больше не сможете сделать за тот период, что закрыт в SH3 - потрудитесь нужные отчеты распечатать заранее. Зато останется история по товарам.
4. Да идет в сад эта "концепция". Помимо прочего, если на товар не делать комплект, то по бухгалтерии его надо проводить не как "производство", а как "розничная торговля", а в подавляющем большинстве ресторанов - это геморрой. Поэтому я всегда советую все равно создавать комплекты. Даже на бутылки вина. Официант же открывает ее перед подачей гостю? Значит, производство
Ну и бланк инвентаризации можно делать по одной и той же товарной группе. А то для бара получается, что штучка в одном месте, а розлив - в другом. Приходится назначать одинаковые категории, а если разбивка по категориям требуется для другого, то... В общем, нужна эта концепция довольно редко.
5. "Услуга" или "Ссылка" нужны редко. Услугой надо пользоваться вообще аккуратно, потому что если в кипере на блюдо, которое в хаусе сделано как услуга, поставить модификатор(ы), то расход за этот день не получить. Идиотская "фича". Почему нельзя ошибку проигнорить и все остальное скачать - за такой маразматический отказ надо программистам отрывать руки.
Ну и если сильно надо впоследствии - удаляется товар в кипере, заводится заново, получаем в хаусе новый товар, и обозначаем его как угодно по-новому...

Добавлю, что автоматическую перекачку из SH3 в SH4 проводили уже дважды. В целом - без видимых проблем.
Правда, в своем ресторане я все перебивал ручками, но это мне не лень было, и очень хотелось от мусора избавиться.