Смысл в разделении не понятен, но если так решили, то: для каждого подразделения копируем свою папку RK6, правим пути в rkeeper.ini, удаляем ненужные блюда в меню, модификаторы, персонал и т.д. Файлы с подчеркиванием либо очищаем, либо заменяем на чистые из NewDB. Настраиваем пути в local.db на сервере каждого подразделения в свой ENDDAY и в свою DB. Также нужно не забыть, что в каждом (!) подразделении должна быть одна (!) главная касса, на которой в RKCLIENT должна быть папка RESULTS.