Вы бы попробовали после прошивки прокатать карту в Windows (например в блокноте)?
У вас сейчас она будет читаться так:
В Порт клавы при этом валится следующее ;[Enter]2209
Соответственно кипер воспринимает это так: Нажатие Ентер (открытие нового стола) - ввод цифр 2209.
Вы прошили не правильно.
Header - это префикс. То что будет передано в порт перед содержимым карты.
Terminator - окончание, постфикс. То что будет передано в порт после того что считано с карты.
1. Перенесите Enter на закладку Terminator.
2. Если вы совсем никак не программируете вторую дорожку (если она вам не нужна) то снимите галку с нее. Если нужна (например, карты персонала читать) то на нее так же потребуется префикс ";" и терминатор "Ентер"
3. Я не совсем уверен что в качестве терминатора нужно именно код отжатия Ентер. Поэкспериментируйте с этим.