Достаточно сохранить один документ с такой настройкой, и далее все документы будут использовать эту настройку по умолчанию. Точно так же, если эту галку потом убрать и сохранить документ, то все последующие будут создаваться без нее.
Это относится и другим настройкам, в т.ч. склада-получателя, "поставить в начало даты" и др.