С точки зрения методологии ведения учета РАР - это не проблема, а норма (ну не хотят они вникать в тонкости ХоРеКа, ну что тут поделать).
И точку зрения UCS я понимаю (и даже разделяю): хранить у себя марки без уверенности что они действительно придут (когда нибудь) на остатки - это не очень...
Сейчас, пока в поставках марки не указываются, возможно это и был бы вариант. Но дальше, когда ЕГАИС перейдет на помарочный учет, вы отсканируете марку (без сверки с остатками), она в итоге на остатках (не важно какого регистра) так и не появится (потому что поставщик отписал одно, а привез другое), списание не пройдет (в лучшем случае, а в худшем уйдет марка которая за вами не числится). И кто будет у вас виноват? Не разработчик ли???